Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms