Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift88Q61371 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift88Q61371 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms