Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd1Q61345 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms