Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna2Q61301 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna2Q61301 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms