Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms