Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d1Q60949 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms