Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms