Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms