Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms