Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms