Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smim9Q3V0X1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim9Q3V0X1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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