Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr7Q3V0I2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr7Q3V0I2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms