Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms