Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfi1Q3UZY0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms