Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrfip1Q3UZ39 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms