Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms