Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsponQ3UPR9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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