Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms