Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf10Q3UIW5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf10Q3UIW5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms