Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms