Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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