Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q3U595 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q3U595 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q3U595 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms