Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssbp4Q3U4B1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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