Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk3Q3U3Q1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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