Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
1700066B19RikQ3TS39 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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1700066B19RikQ3TS39 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
1700066B19RikQ3TS39 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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1700066B19RikQ3TS39 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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