Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca4Q3TKT4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms