Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms