Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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