Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms