Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam178bQ24JP3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms