Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Shroom4Q1W617 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shroom4Q1W617 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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