Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3ip1Q149C2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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