Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata18Q0P557 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms