Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbp2Q08652 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbp2Q08652 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms