Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms