Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cntn3Q07409 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cntn3Q07409 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cntn3Q07409 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cntn3Q07409 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntn3Q07409 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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