Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Prrx2Q06348 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms