Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cab39Q06138 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms