Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms