Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox8Q04886 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox8Q04886 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox8Q04886 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sox8Q04886 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms