Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms