Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcad1Q04692 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms