Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnb1Q03717 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms