Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms