Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Crisp3Q03402 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms