Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Msx2Q03358 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms