Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms