Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Htr1fQ02284 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms