Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai1Q02085 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai1Q02085 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai1Q02085 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai1Q02085 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai1Q02085 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms