Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GabpaQ00422 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms